2.系统性红斑狼疮
雌激素有免疫激活作用，可引起系统性红斑狼疮的病情活动。服含雌激素的避孕药者发生系统性红斑狼疮的危险性稍有增高，但后来的病例对照研究未证实该结论，这可能与研究设计、患者选择及评估疾病复发方法的不同有关。
活动期系统性红斑狼疮患者推荐用屏障避孕法或口服仅含孕激素的避孕药，但长期用激素者用甲羟孕酮可能会使骨丢失危险性增高。免疫抑制剂使用过强过长者不建议使用节育环避孕，因有诱发感染的危险。
3.类风湿关节炎
类风湿关节炎患者在怀孕期的关节症状可得到改善，而分娩后疾病复发的危险性增高，提示雌孕激素可能对缓解类风湿关节炎关节症状有益。
早期研究发现，正服用避孕药者发生类风湿关节炎的机率减少50%，但也有研究未显示这种保护作用，因此在“避孕药是否降低发生类风湿关节炎风险”上仍存在争论。
口服避孕药不影响类风湿关节炎患者的病情，甚至可减轻类风湿关节炎的病情严重性，因此，患者可用含雌孕激素口服剂型或经皮贴剂型的避孕药。
理论上来说，类风湿关节炎患者使用第二代避孕药(含较多有雄激素作用的孕激素)更为合适，因更能发挥孕激素的雄激素样免疫抑制作用。此类患者可能因关节病变严重而难以完成放置阴道隔膜或阴道环的动作。另外，长期大剂量使用免疫抑制药者禁用节育环避孕。
4.其他自身免疫病
研究显示，静脉用雌激素可缓解系统性硬化症的严重雷诺现象，但口服含雌激素的避孕药并不影响雷诺现象发作的频率和严重性。尚无研究资料显示雌激素对系统性血管炎的影响。
总之，目前供风湿病患者避孕的方法比较多，风湿病医生和患者都应该清楚的了解疾病本身及各种避孕方法的优缺点，从而选择安全有效的避孕方法。
